Kapitola 1
LABORATÓRNA DIAGNOSTIKA
1.1 Lekárska mikrobiológia a klinická mikrobiológia. Pracoviská klinickej mikrobiológie a ich organizácia na národnej úrovni
1.2 Organizácia, materiálno-technické vybavenie, informačné systémy a manažment pracoviska v klinickej mikrobiológii
1.3 Laboratórne informačné systémy
1.4 Kontrola kvality v mikrobiologickej diagnostike
1.5 Úlohy a pôsobnosť klinickej mikrobiológie v rámci liečebno-preventívnej starostlivosti a komunikácia s ostatnými klinickými odbormi
1.6 Prevencia a kontrola laboratórnych nákaz
1.7 Dekontaminácia, dezinfekcia a sterilizácia
1.8 Zásady odberu, spracovania a uchovávania materiálu pre mikrobiologickú diagnostiku
1.9 Algoritmy mikrobiologických vyšetrení. Manuálne a automatizované systémy v klinickej mikrobiológii
1.10 Separačné techniky, ktoré sa uplatňujú v lekárskej mikrobiológii
1.11 Mikroskopické techniky v klinickej mikrobiológii
1.12 Farbenia a preparačné techniky v klinickej mikrobiológii
1.13 Kultivácia mikroorganizmov
1.14 Identifikácia izolovaných baktérií pomocou testov na určenie metabolických vlastností
1.15 Fagotypizácia baktérií
1.16 Testovanie citlivosti mikroorganizmov voči antimikrobiálnym látkam
1.17 Spektrometrické metódy v mikrobiologickej diagnostike
1.18 Elektrochemické metódy v lekárskej mikrobiológii
1.19 Optické analýzy – fotometria, spektrofotometria, fluorimetria a chemiluminometria
1.20 Analýza nukleových kyselín a molekulárno-genetické metódy zisťovania prítomnosti, identifikácie a vlastností mikroorganizmov
1.21 Imunochemické a iné imunologické techniky v lekárskej mikrobiológii
1.22 Prietoková cytometria v klinickej mikrobiológii
1.23 Biosenzory
1.24 Výsledok laboratórnej diagnostiky
Kapitola 2
Imunitný systém
2.1 Vlastnosti imunitného systému
2.2 Imunitná odpoveď na mikroorganizmy
2.3 Aktívna a pasívna imunizácia
Kapitola 3
BAKTERIOLÓGIA
3.1 Klasifikácia baktérií
3.2 Tvar a štruktúra bakteriálnej bunky
3.3 Rast a metabolizmus mikroorganizmov
3.4 Genetika baktérií
3.5 Vzťah baktérií a človeka
3.6 Vznik a priebeh bakteriálnej infekcie
3.7 Patogénnosť, faktory virulencie a patogenetické mechanizmy baktérií
3.8 Fenotypová adaptácia baktérií vo vonkajšom prostredí a v organizme človeka
3.9 Laboratórna diagnostika chorôb bakteriálnej etiológie
3.10 Využitie metód molekulárnej biológie pri laboratórnej diagnostike, klasifikácii baktérií a metagenomických štúdiách
3.11 Antibakteriálne liečivá
3.12 Streptococcus
3.13 Enterococcus
3.14 Staphylococcus a ďalšie aeróbne a fakultatívne anaeróbne grampozitívne koky
3.15 Bacillus
3.16 Listeria a ďalšie grampozitívne paličky
3.17 Mycobacterium a príbuzné acidorezistentné baktérie
3.18 Corynebacterium a Arcanobacterium
3.19 Neisseria a príbuzné rody – Eikenella, Kingella
3.20 Enterobacteriales
3.21 Vibrio a Aeromonas
3.22 Haemophilus a príbuzné rody – Actinobacillus, Aggregatibacter, Pasteurella
3.23 Gramnegatívne nefermentujúce baktérie
3.24 Gramnegatívne mikroaerofilné paličky – Campylobacterales
3.25 Kultivačne náročné gramnegatívne baktérie
3.26 Anaeróbne baktérie
3.27 Spirochéty – rod Treponema, Borrelia a Leptospira
3.28 Mollicutes – Mycoplasma a Ureaplasma
3.29 Striktne intracelulárne baktérie – Rickettsia, Orientia, Coxiella, Ehrlichia a Anaplasma
3.30 Chlamydia
3.31 Cyanobacteria
Kapitola 4
VIROLÓGIA
4.1 Klasifikácia vírusov, štruktúra a replikácia
4.2 Patogenéza vírusových infekcii
4.3 Infekcie spôsobené vírusmi
4.4 Laboratórna diagnostika vírusových ochorení
4.5 Antivírusová liečba
4.6 Papilomavírusy a polyomavírusy
4.7 Adenovírusy
4.8 Herpesvírusy
4.9 Poxvírusy
4.10 Parvovírusy
4.11 Pikornavírusy
4.12 Koronavírusy a norovírusy
4.13 Paramyxovírusy
4.14 Orthomyxovírusy
4.15 Rhabdovírusy
4.16 Filovírusy
4.17 Bornavírusy
4.18 Reovírusy
4.19 Togavírusy – Togaviridae
4.20 Flavivírusy
4.21 Bunyaviridae a Arenaviridae vírusy
4.22 Retrovírusy
4.23 Vírusy hepatitíd
4.24 Prióny
Kapitola 5
Parazitológia
5.1 Úvod do lekárskej parazitológie
5.2 Prvoky
5.3 Parazitické helminty
5.4 Parazitické článkonožce (Arthropoda)
5.5 Antiparazitárne liečivá
Kapitola 6
Mykológia
6.1 Systematika mikroskopických húb
6.2 Patogenéza mykotických ochorení
6.3 Huby asociované s ochoreniami u ľudí
6.4 Laboratórna diagnostika húb
6.5 Ochorenia vyvolané mikroskopickými hubami
6.6 Povrchové kvasinkové infekcie kože a slizníc
6.7 Invazívne kvasinkové infekcie u pacientov s AIDS
6.8 Invazívne kvasinkové a plesňové infekcie u non-AIDS pacientov
6.9 Infekcie spôsobené dimorfnými a vláknitými hubami Invazívne mykózy v subtrópoch a v trópoch (dimorfné endemické mykózy)
6.10 Mykoalergie
6.11 Sekundárne metabolity mikromycét – mykotoxíny a ich biologické účinky
6.12 Antifungálna chemoterapia a profylaxia
Kapitola 7
Klinická mikrobiológia
7.1 Normálne osídlenie kože a slizníc
7.2 Infekcie horných dýchacích ciest
7.3 Infekcie dolných dýchacích ciest a pľúc
7.4 Infekcie srdcovocievneho systému a krvi
7.5 Infekcie centrálneho nervového systému
7.6 Infekcie oka
7.7 Infekcie rán, mäkkých tkanív a dutiny brušnej
7.8 Infekcie kostí a kĺbov
7.9 Infekcie spôsobené anaeróbnymi nesporulujúcimi a sporulujúcimi mikroorganizmami
7.10 Infekcie kože
7.11 Infekcie ohrozujúce vývoj plodu a novorodenca
7.12 Infekcie genitálneho traktu a pohlavne prenosné ochorenia
7.13 Infekcie močových ciest
7.14 Gastritídy, črevné nákazy a alimentárne intoxikácie
7.15 Infekcie pečene a hepatobiliárneho systému
7.16 Nozokomiálne infekcie
7.17 Infekcie u imunosuprimovaných pacientov
7.18 Infekcie súvisiace s biofilmom a cudzím telesom
7.19 Infekcie zapríčinené biologickou zbraňou
7.20 Princípy racionálnej antiinfekčnej liečby
7.21 Epidemiologicko-mikrobiologická kontrola vybraných infekčných nákaz
Kapitola 8
Infekcie v dutine ústnej
8.1 Mikrobiológia orálnych infekcií
8.2 Zubný plak
8.3 Akútne gingivitídy
8.4 Chronické infekcie
8.5 Infekcie slinných žliaz
8.6 Fokálne infekcie dentogénneho pôvodu
